ישנם מספר הבדלים בין ספר החשבונות הכללי לבין יתרת הניסיון, שהם כדלקמן:
- כמות המידע . ספר החשבונות הכללי מכיל את העסקאות המפורטות הכוללות את כל החשבונות, בעוד יתרת הניסיון מכילה רק את יתרת הסיום בכל אחד מאותם חשבונות. לפיכך, ספר החשבונות הכללי עשוי להיות בן כמה מאות עמודים, בעוד יתרת הניסיון מכסה רק כמה עמודים.
- שימוש . ספר החשבונות הכללי משמש כמקור המידע העיקרי על ידי רואי החשבון הפיננסי כאשר הם חוקרים חשבונות. ליתרת הניסיון יש שימוש מוגבל הרבה יותר, כאשר משווים את סך כל החיובים והזיכויים בכדי לוודא שהספרים נמצאים באיזון.
- שימוש מבקר . רואי החשבון מבקשים העתק מיתרת הניסיון במסגרת ביקורתם בסוף השנה, כך שיהיו להם יתרות סופיות לכל החשבונות. הם משתמשים בספר החשבונות הכללי למטרה אחרת, והיא איתור היתרות לעסקאות בודדות.
- אופי המידע . ספר החשבונות הכללי נחשב למאגר מידע אודות עסקאות חשבונאיות, בעוד יתרת הניסיון היא למעשה רק דוח שמקורו בספר החשבונות הכללי.