הנהלת חשבונות ניהולית כוללת איסוף, ניתוח ודיווח על אודות הפעילות והכספים של העסק. דו"חות אלה מופנים בדרך כלל למנהלי עסק, ולא לכל גורם חיצוני, כגון בעלי מניות או מלווים. הפונקציות של חשבונאות ניהולית כוללות את הפעולות הבאות:
ניתוח שוליים . קביעת כמות הרווח או תזרים המזומנים שהעסק מייצר ממוצר, קו מוצרים, לקוח, חנות או אזור ספציפיים.
שובר ניתוח . חישוב התמהיל של שולי התרומה ונפח היחידות שבו עסק מתפרק במדויק, דבר שימושי לקביעת נקודות מחיר עבור מוצרים ושירותים.
ניתוח אילוצים . הבנה היכן נמצאים צווארי הבקבוק העיקריים בחברה, וכיצד הם משפיעים על יכולתו של העסק להרוויח הכנסות ורווחים.
עלות יעד . סיוע בתכנון מוצרים חדשים על ידי צבירת עלויות של עיצובים חדשים, השוואתם לרמות עלות יעד, ודיווח מידע זה להנהלה.
הערכת מלאי . קביעת העלויות הישירות של עלות טובין שנמכרו ופריטי מלאי, וכן הקצאת עלויות תקורה לפריטים אלה.
ניתוח מגמות . סקירת קו המגמה של עלויות שונות שנוצרו כדי לראות אם קיימות שונות חריגה מהדפוס לטווח הארוך, ודיווח על הסיבות לשינויים אלה להנהלה.
ניתוח עסקאות . לאחר שזיהה שונות באמצעות ניתוח מגמות, אדם העוסק בחשבונאות ניהולית עשוי לצלול עמוק יותר למידע הבסיסי ולבחון עסקאות בודדות, כדי להבין בדיוק מה גרם לשונות. מידע זה נצבר לדוח להנהלה.
ניתוח תקצוב הון . בחינת הצעות לרכישת רכוש קבוע, הן כדי לקבוע אם יש צורך בכך והן מהי צורת המימון המתאימה לרכישה.
בהתחשב במגוון הרחב של פעילויות החקירה והניתוח שצוינו לעיל, נוכל לקבוע כי רואי חשבון מנהלים פועלים בתפקיד ייעוץ, להזהיר מנהלים מפני נושאים קרובים ולהפנות את תשומת ליבם לכדי הזדמנויות רווחיות.
סוג החשבונאות הנוסף הוא חשבונאות פיננסית, העוסקת ברישום ודיווח תקין של עסקאות חשבונאיות כדי להיות תואם את המסגרת החשבונאית החלה (כגון עקרונות חשבונאות מקובלים או תקני דיווח פיננסי בינלאומיים). התפוקה העיקרית של חשבונאות פיננסית היא הדוחות הכספיים.