מערכת ידנית היא מערכת הנהלת חשבונות בה הרשומות מתוחזקות ביד, ללא שימוש במערכת מחשב. במקום זאת, עסקאות נכתבות בכתבי עת, מהם המידע מגולגל באופן ידני למכלול דוחות כספיים. מערכות אלו סובלות משיעור שגיאות גבוה, והן איטיות בהרבה ממערכות ממוחשבות. מערכות ידניות נמצאות לרוב בארגונים קטנים שיש להם מעט עסקאות.
