החלטות תפעוליות הן קביעות המתייחסות לשגרה ולפעילות שוטפת של הארגון. דוגמאות להחלטות הפעלה הן:
- אילו הזמנות של לקוחות מתוזמנות לייצור
- אילו רכיבים וחומרי גלם לקנות מספקים
- תזמון ציוד ייצור לשימוש
- החלטה על אופי קמפיין שיווקי
- החלטה היכן להשקיע עודפי כספים
- קביעת כמות המלאי שיש להחזיק בהישג יד
החלטות הפעלה מתקבלות במסגרת החלטות אסטרטגיות ארוכות טווח.