הוצאות התוכנית הן הוצאות שנגרמו על מנת לספק תוכניות ספציפיות בהתאם למשימה של גוף ללא מטרות רווח. הוצאות אלו נבדלות משאר הקטגוריות העיקריות של הוצאות לעמותה, שהן הוצאות גיוס כספים והוצאות ניהול וניהול. התורמים רוצים לראות שיעור גבוה של הוצאות המתבצעות בתחום הוצאות התוכנית, מה שמעיד על יעילות משימות גבוהה.
