ישנם מספר הבדלים בין חשבונאות עלויות לחשבונאות פיננסית, כדלקמן:
קהל . חשבונאות פיננסית כוללת הכנת מערכת סטנדרטית של דוחות לקהל חיצוני, שיכולה לכלול משקיעים, נושים, סוכנויות דירוג אשראי וסוכנויות רגולטוריות. חשבונאות עלויות כוללת הכנת מגוון רחב של דוחות שההנהלה זקוקה להם לצורך ניהול עסק.
פורמט . הדוחות שהוכנו במסגרת חשבונאות פיננסית הם ספציפיים מאוד במתכונתם ובתוכנם, כפי שמורה על פי עקרונות חשבונאיים מקובלים או על פי תקני דיווח פיננסי בינלאומיים. חשבונאות עלויות כוללת יצירת דוחות שיכולים להיות בכל פורמט שצוין על ידי ההנהלה, מתוך כוונה לכלול רק את המידע הרלוונטי להחלטה או למצב ספציפי.
רמת פירוט . חשבונאות פיננסית מתמקדת בעיקר בדיווח על התוצאות הכספיות ומצבה הכספי של גוף עסקי שלם. חשבונאות עלויות מביאה בדרך כלל לדוחות ברמת פירוט גבוהה בהרבה בחברה, כגון עבור מוצרים בודדים, קווי מוצרים, אזורים גיאוגרפיים, לקוחות או חברות בנות.
עלויות מוצר . חשבונאות עלויות קובעת את עלות חומרי הגלם, מלאי העבודה בתהליך ומוצרים מוגמרים, ואילו חשבונאות פיננסית משלבת מידע זה בדוחות הכספיים (בעיקר במאזן).
מסגרת רגולטורית . מבנה הדוחות החשבונאיים הפיננסיים נשלט על ידי עקרונות חשבונאיים מקובלים או תקני דיווח פיננסי בינלאומיים. אין מסגרת רגולטורית המסדירה את דוחות חשבונאות העלויות.
דווח על תוכן . דוח פיננסי מכיל צבירה של המידע הכספי שנרשם באמצעות מערכת הנהלת החשבונות. המידע בדוח חשבונאות עלות יכול להכיל גם מידע פיננסי וגם מידע תפעולי. המידע התפעולי יכול להגיע ממגוון מקורות שאינם בשליטה ישירה של מחלקת הנהלת חשבונות.
תזמון דיווח . אנשי הנהלת חשבונות פיננסיים מנפיקים דוחות רק בסוף תקופת דיווח. צוות חשבונאות עלויות רשאי להוציא דוחות בכל עת ובכל מידה של תדירות, בהתאם לצורך של ההנהלה במידע.
אופק זמן . חשבונאות פיננסית עוסקת רק בדיווח על תוצאות תקופות דיווח שכבר הושלמו. חשבונאות עלויות עושה זאת גם, אך גם יכולה להיות מעורבת במגוון תחזיות לתקופות עתידיות.
בקצרה, ההבדלים העיקריים בין עלות לחשבונאות פיננסית הם שחשבונאות עלויות מתמקדת באופן פנימי בהחלטות הניהול, ואילו חשבונאות פיננסית מתמקדת בהוצאת דוחות כספיים לגורמים חיצוניים.
