עלויות כשל פנימי הן עלויות איכות הקשורות לכשלים במוצר שמתגלים לפני יציאת המוצר מהמפעל. כשלים אלה מתגלים בתהליכי הבדיקה הפנימיים של המשרד. דוגמאות לעלויות כשל פנימיות הן:
פעילויות ניתוח כשלים
עלויות עיבוד מחדש של מוצרים
המוצר נגזר, נטו מכירות גרוטאות
התפוקה אבודה
עלויות כשל פנימי הן אחת מארבע עלויות האיכות. שלוש העלויות האחרות הן עלויות מניעה, עלויות שמאות ועלויות כשל חיצוני.