קייזן נוהג בשיפור מתמיד של תהליכים והפחתת עלויות. הרעיון נוטה להניב שיפורים הדרגתיים לאורך תקופה ארוכה. ניתן ליישם תפיסה זו לתקצוב על ידי שילוב של הפחתת עלויות צפויה בתוצאות המתוכננות של עסק. ניתן להשתמש בגישה זו כדי להוזיל עלויות מתחת לרמות הנוכחיות שלהם באופן רציף.
תקצוב קייזן דורש תכנון רב של ההנהלה מכיוון שעליהם להקדיש מספיק זמן ומשאבים לבחינת כל ההיבטים של העסק, לאתר פרויקטים של שיפור אפשרי ולוודא שהפרויקטים האלה יושלמו בהצלחה. כמו כן, יש לשקול את העלויות של פרויקטים אלה לשיפור בתקציב, יחד עם החיסכון הצפוי בקייזן.
ניתן לתקצב את סכום הפחתת העלויות עקב פעילויות קייזן על בסיס פרויקטים ספציפיים של שיפור מתוכנן. עם זאת, סביר להניח שתקופת התקציב מכסה שנה ופרויקטים לשיפור עשויים לכסות פרקי זמן קצרים בהרבה, ולכן קשה לקשר בין שיפורים ספציפיים לתקופת התקציב כולה. חלופה היא להזין את האחוז ההיסטורי של הפחתת העלויות לתקציב, ולהסתמך על פעילויות קייזן מתמשכות כדי להתאים בערך לסכום הפחתת העלויות המתוקצבת.
הכללת הפחתת עלויות kaizen בתקציב שימושית לשיפוט ביצועי המנהלים, על ידי התאמת ציפיות מתוקצבות להפחתת עלויות בפועל שהם מייצרים לאורך זמן. ניתן להשתמש במידע זה בבחינת מבצעים, כמו גם בתשלומי בונוס.
ישנן שתי בעיות עיקריות בשימוש בתקצוב kaizen, והן:
יתכן ויהיה קל יותר להשיג הפחתת עלויות בשנים הראשונות, כאשר ניתן לאתר "פרי תלוי נמוך"; לאחר שהושגה הפחתת עלויות ראשונית אלה, אחוז הפחתת העלויות המופעלת על ידי קייזן עשוי לרדת, מה שמפעיל לחץ מוגבר על המנהלים לבצע.
אם לא ניתן להשיג הפחתת עלויות הקשורה לקאיזן, יתכן שאפילו רווחים ותזרימי מזומנים מתוקצבים אינם ניתנים להשגה מרחוק, וכתוצאה מכך נוצרים שינויים לא נוחים משמעותיים מהתקציב.
